Oberstes Organ von Pro Velo St.Gallen Appenzell ist die Mitgliederversammlung, die einmal jährlich auf Einladung zusammen kommt. An der Mitgliederversammlung werden Wahlen veranlasst, vergangene Aktionen ausgewertet, Anlässe bekannt gegeben usw. Der Vorstand trifft sich regelmässig zu Vorstandssitzungen.
Grundsätzlich wird angestrebt, Entscheide im Konsens zu treffen. Bei Dissens entscheidet die Mehrheit durch eine Abstimmung.
Ziel ist es gewisse Aufgaben in entsprechenden Fachgruppen zu bewältigen und so aktiv Lösungen und Projekte zu lancieren.
Pro Velo St.Gallen Appenzell funktioniert teilautonom. Sie unterliegt bis auf das Grundsatzpapier Pro Velo Schweiz keinerlei formalen strukturellen, finanziellen, oder politischen Vorgaben.
